Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ube2fQ9CY34 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms