Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nip7Q9CXK8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nip7Q9CXK8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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