Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Utp23Q9CX11 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms