Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ly6kQ9CWP4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ly6kQ9CWP4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ly6kQ9CWP4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ly6kQ9CWP4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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