Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NubplQ9CWD8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NubplQ9CWD8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms