Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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