Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snw1Q9CSN1 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Snw1Q9CSN1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms