Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Atp6v0e1Q9CQD8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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