Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pkp2Q9CQ73 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pkp2Q9CQ73 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms