Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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Pole4Q9CQ36 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Pole4Q9CQ36 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Pole4Q9CQ36 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Pole4Q9CQ36 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
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Pole4Q9CQ36 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Pole4Q9CQ36 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Pole4Q9CQ36 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Pole4Q9CQ36 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pole4Q9CQ36 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Pole4Q9CQ36 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Pole4Q9CQ36 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pole4Q9CQ36 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Pole4Q9CQ36 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pole4Q9CQ36 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms