Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chmp3Q9CQ10 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chmp3Q9CQ10 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms