Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Tdrd1Q99MV1 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Tdrd1Q99MV1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tdrd1Q99MV1 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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