Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Nus1Q99LJ8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms