Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rcbtb2Q99LJ7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms