Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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Prpf19Q99KP6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Prpf19Q99KP6 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Prpf19Q99KP6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms