Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Lims1Q99JW4 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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