Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Rnf144aQ925F3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Rnf144aQ925F3 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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