Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atl3Q91YH5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atl3Q91YH5 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms