Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cabp4Q8VHC5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cabp4Q8VHC5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms