Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB2

Alg12, Dol-P-Man:Man(7)GlcNAc(2)-PP-Dol alpha-1,6-mannosyltransferase, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg12Q8VDB2 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Alg12Q8VDB2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alg12Q8VDB2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alg12Q8VDB2 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alg12Q8VDB2 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alg12Q8VDB2 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alg12Q8VDB2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Alg12Q8VDB2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alg12Q8VDB2 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Alg12Q8VDB2 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Alg12Q8VDB2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.9 ms