Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Vmn1r200Q8R281 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Vmn1r200Q8R281 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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