Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Rnf183Q8QZS5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms