Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Colec12Q8K4Q8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms