Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Lrrtm1Q8K377 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Lrrtm1Q8K377 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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