Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ncapd2Q8K2Z4 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ncapd2Q8K2Z4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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