Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SbsnQ8CIT9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SbsnQ8CIT9 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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