Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Brf1Q8CFK2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brf1Q8CFK2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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