Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Klhl11Q8CE33 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms