Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

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Length 866 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc178Q8CDV0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Ccdc178Q8CDV0 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc178Q8CDV0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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