Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp20Q8C6M1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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