Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Amigo3Q8C2S7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Amigo3Q8C2S7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Amigo3Q8C2S7 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Amigo3Q8C2S7 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Amigo3Q8C2S7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Amigo3Q8C2S7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Amigo3Q8C2S7 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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