Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Znf428Q8C1M2 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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