Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Ttc21aQ8C0S4 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc21aQ8C0S4 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc21aQ8C0S4 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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