Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rbbp5Q8BX09 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms