Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ctdsp2Q8BX07 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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