Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtpaQ8BWP5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms