Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Pggt1bQ8BUY9 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pggt1bQ8BUY9 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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