Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Tspan12Q8BKT6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms