Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
H2-M10.4Q85ZW8 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
H2-M10.4Q85ZW8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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