Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Avl9Q80U56 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms