Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Olfr616-201ENSMUST00000106886 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 2900076A07Rik-203ENSMUST00000180879 725 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm28384-201ENSMUST00000189079 463 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Olfr949-ps1-201ENSMUST00000215546 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 AC108437.1-201ENSMUST00000222170 776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Olfr1217-201ENSMUST00000099799 1105 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Prkg2-204ENSMUST00000162147 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 4930599N23Rik-201ENSMUST00000146981 880 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SnphQ80U23 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms