Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Dsg1bQ7TSF1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms