Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Dsg1cQ7TSF0 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Dsg1cQ7TSF0 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms