Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmed3Q78IS1 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms