Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Usp49Q6P9L4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Usp49Q6P9L4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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