Protein–RNA interactions for Protein: Q684R7

Frem1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Frem1Q684R7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Frem1Q684R7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Frem1Q684R7 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms