Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc18Q640L5 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc18Q640L5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms