Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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PcolceQ61398 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
PcolceQ61398 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
PcolceQ61398 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
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