Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cln3Q61124 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cln3Q61124 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms