Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Grik1Q60934 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Grik1Q60934 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Grik1Q60934 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Grik1Q60934 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Grik1Q60934 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Grik1Q60934 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Grik1Q60934 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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